A realização de punção lombar em pacientes com tumores cerebrais pode levar a herniação cerebral, e portanto só deve ser realizado em pacientes com suspeita de infecção do SNC ou de metástase meníngea. E o ideal é que o neurocirugião avalie o risco do procedimento. Deve ser precedida de investigação radiológica para avaliar o risco de herniação.
As alterações do líquor em pacientes com tumores primários ou secundários no SNC podem incluir: aumento da pressão de abertura, aumento do nível de proteína, linfocitose discreta. O líquor raramente contem células malignas, com exceção às metástases leptomeníngeas, linfoma primário do SNC e tumores neuroectodérmicos primitivos (PNETs, incluindo o meduloblastoma).